[Case] Should I use GCP for gene sequencing analysis? How to save on cloud costs revealed | 3 ways to quickly compare!

基因定序分析 3種伺服器的選擇

1. 地端工作站

在生物資訊領域，基因定序分析常常需要處理大量的資料。有些資料分析需要較高的核心數，也有些則是需要較高的RAM記憶體，在分析上傳統上首選會是以自購伺服器，成立一個工作站來做使用，好處就是剛開始還不需要大量運算資料時，這樣購入且產出資料是最划算的。

但隨著需要分析的資料量逐漸攀升，會漸漸的發現算力資源不足，此時若要新購設備或是擴充設備，龐大的設備費用又會是令人退卻，並且得謹慎評估是否可以因應如五年內的需求，否則買了一台貴鬆鬆的設備卻用不到幾年，就有點不划算了！

2. 公有雲：彈性的運算主機

公有雲主機租賃服務，如AWS、GCP或Azure等，可以解決這些問題，如今天有一個研究案需要將某物種的基因片段全部重組出來，那就很需要一台強大的高運算主機，這時候如果自己買GPU費用都很可觀，所以租賃一台雲主機來運算，雲主機是依照主機啟用時數來計費，不需要的時候可以先關閉，「用多少付多少」且可以每月付款的「彈性支付」，都是公有雲的一大優勢，唯一要注意的是公有雲的資料下載下來的傳輸費用是額外計算，所以對於基因定序這種資料龐大的研究，有時候頻寬費用就會不小心高的嚇人😱

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3. 實體主機租賃 | 機房代管

一旦日常運算有穩定的量，此時為了節省雲端每個月高額的費用，有些公司會考慮從雲端搬回地端，但這邊的地端指的不是自建機房、自己採買設備，而是直接租賃主機並放置在資料中心大樓，這一類的服務稱為「IDC機房服務」，公司可以把自己的機器搬到資料中心，也可以租賃主機直接託管，搬到資料中心的好處是，

第一個，不用擔心自己機房斷電，遇到人為因素產生的營運中斷；

第二點，省去公有雲高額的頻寬傳輸費用；

第三點，享有雲端彈性付款不用一次買斷的費用.

在IDC資料中心代管，也能省去IT維運的成本，由代管廠商負責幫您遠端現場維護，主機的自主權也在公司，所以不會有資安上的疑慮。且機房代管服務通常都有資安上的配置，如還有做異地機房備份，則是又更加安全！🦾

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實際案例分享

Requester

迪恩捏生技（化名）是一家提供各大醫院、健管中心基因檢測報告服務的公司，除此之外，在學術研究上也有一些國科會和科技部案子需要幫忙老師或醫師來做數據的分析，因此在多年來發展下，本身就有建置機房，放置一些運算用的伺服器、NAS網路儲存伺服器等。

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客戶面臨的問題

1	新的運算伺服器。	現有工作站伺服器運算處理算力不敷使用且過老舊，打算新採買設備。
2	龐大的備份空間。 因應基因報告稽查需要保存數年。	由於之前發生過NAS硬碟毀損，資料有遺失，還在尋求更好的保存資料方法。
3	降低維運成本。	持續投入地端機房成本過高，包含冷氣電費和設備、人員維護成本等。

在評估現有設備應對分析的負載量後，決定要添購新的伺服器在自己的地端機房，並找尋更大的儲存設備，來儲存公司的基因定序資料和歷年來的分析報告，同時也必須解決如果大樓突然停電，機房不斷電系統如何供應的問題。

以IT專業角度切入，找尋最佳方案

經由齊瑞科技專業顧問的諮詢後，迪恩捏生技評估自己機房電費成本和需要先採購主機的費用，決定採用齊瑞科技專業機房代管服務，由齊瑞科技提供租賃主機和備份主機，來以最經濟的方式解決客戶問題。

1. 高運算伺服器 Compute Server

由於每個客戶的領域環境不同，量身打造需求化的伺服器就很重要，依照客戶CPU、RAM等需求來給予對應主機。OS環境需求我們也提供預先配置好交付給客戶，並且會給予客戶測試的機會。畢竟使用實體主機租賃機房代管服務，就像是買了一台電腦，如果不好用那也只能將就使用，所以在試用環節上不能少，給予客戶實際運算分析一遍，在確定整體運算、效能、傳輸速度都沒問題，再來租賃服務.

2. 備份主機 Backup Server

提供大空間40TB的備份主機，並設立隔離層由Compute Serve運算完後的結果，可以直接進入Backup做儲存備份的動作，因為是大空間所以也有空間作為本身地端的第二份資料存放點，來達到異地備份和備份3-2-1原則，齊瑞的備份主機都有提供Raid 5以上的磁碟陣列保護，因為是租賃備份主機，所以在設備、硬碟損壞等問題，都不需要額外費用，維修的時間也依照SLA服務等級來執行，這也是機房代管的一大優勢！

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3. FTP Server

另外還有一台FTP Server負責對外分享一些檔案，常見在一些婚攝、影像和影印店，都會以這個形式分享資料給客戶，這些一樣做好設定，就可以很快的把一些研究資料或定序資料跟外部做交換。

結語

對於目前全球和政府所正在推行的碳排淨零政策，很多服務上雲端無疑是一種趨勢，但撇除了大環境的影響，以公司的長期利益出發，還是要謹慎的考量現階段要採取怎麼方式，是地端工作站？還是使用公有雲服務？抑或是找有品質的私有雲機房代管服務？然而這些都是取決於公司的目前的狀態，並不是說無法調整，更常見的做法是動態調整，到一定的規模和穩定的營收後，才會考量下一個階段的模式，希望此篇能解決正在煩惱IT預算的您，如果有任何需要諮詢的也歡迎和我們聯絡，我是零NG，讓你的IT不NG，那我們下次見！